蛋白層析柱是凝膠層析技術中的主體，我們研究所用的就是同興玻璃儀器，一般用玻璃管或有機玻璃管。根據樣品混合物中各組分在固定相和流動相中分配系數不同，從而分離的一種層析法。
蛋白層析柱是凝膠層析技術中的主體，一般用玻璃管或有機玻璃管。層析柱的直徑大小不影響分離度，樣品用量大，可加大柱的直徑，一般制備用凝膠柱，直徑大于2厘米，但在加樣時應將樣品均勻分布于凝膠柱床面上。此外，直徑加大，洗脫液體體積增加，樣品稀釋度大。
層析柱的直徑大小不影響分離度，樣品用量大，可加大柱的直徑，一般制備用凝膠柱，直徑大于2厘米，但在加樣時應將樣品均勻分布于凝膠柱床面上。此外，直徑加大，洗脫液體體積增加，樣品稀釋度大。分離度取決于柱高，為分離不同組分，凝膠柱床要有適宜的高度，分離度與柱高的平方根相關，但由于軟凝膠柱過高擠壓變形阻塞，一般不超過1米。
注意事項：
1、各接頭不能漏氣，連接用的小乳膠管不要有破損，否則造成漏氣、漏液。
2、裝柱要均勻，既不過松，也不過緊，要在要求的操作壓下裝柱，流速不宜過快，避免因此壓緊凝膠。
3、始終保持柱內液面高于凝膠表面，否則水分蒸發，凝膠變干。也要防止液體流干，使凝膠混入大量氣泡，影響液體在柱內的流動。
4、所用凝膠比較昂貴，需小心操作，實驗后回收，盡量避免浪費和損失。
