制備液相色譜儀，是一款功能強大、兼容性高、效率高的模塊化制備色譜系統。該儀器是在經典色譜的基礎上，引用氣相色譜理論，從技術上將流動相改為高壓輸送的。實驗室使用的測試儀器很多，其中液相色譜就是其中之一。
制備液相色譜儀的柱越長，分離度越高，但柱壓更高，分離所需時間更長；但分離度與理論塔板數的平方根成正比，所以一昧增加柱長并不是很有效的分離手段，一般情況下，150mm、5um的填料可以提供足夠的塔板數。
流動相通過高壓泵進入系統，樣品溶液通過注射器進入流動相，流動相加載到色譜柱(固定相)中。由于樣品溶液中各組分在兩相中的分配系數不同，經過兩相反復吸附-解吸分配后，各組分的運動速度有很大的不同。它被分離成一個單獨的組件，然后依次從列中流出。當樣品濃度通過檢測器時，樣品濃度被轉換成電信號并傳送給記錄器，數據以地圖的形式打印出來。
而對于粒徑來說，它影響的則是色譜分離度，粒徑越小，分離越快，柱效越高，但柱壓力越高，柱容易被污染，導致柱壽命降低。常見分析柱通常使用5um填料，復雜的多組分樣品分離一般使用3.5um粒徑，更大內徑的制備色譜柱通常使用更大的粒徑。
如果固定相選擇是正確，但是分離度不夠，那么選用更小的粒度的填料是很有用的。3.5um填料填充柱的柱效比相同條件下的5um填料的柱效提高近30%；然而，3.5um的色譜柱的背壓卻是5um的2倍，因此如何選擇填料粒徑需要根據現實情況而定。
